尽管不同的标准（主要是 ISO 9001 质量、AS/NZS 4801 安全和 ISO 14001 环境标准）适用于任何组织，无论规模大小，小型企业在尝试实施这些标准时面临着独特的困难。
一个主要的困难是，质量、安全和环境管理标准是用一种很难理解的语言编写的，而且可能包含一些元素，让人觉得这些系统很官僚，只适用于大型组织。事实上，质量管理体系不必增加官僚主义和文书工作。自从标准最新版本发布以来，情况一直如此，其中对记录程序的要求要少得多。顾问可以与管理层合作，用简单的语言解释关键的 ISO 9001 要求，并开发一个易于阅读的质量管理体系。然而，并不是所有的小企业都能负担得起顾问的服务。
从成本角度来看，一些小企业主认为，系统开发和认证的成本对于小企业来说太高了。虽然这种情况已经持续多年，但自从 ISO Global 推出其小企业方法以来，数百家中小型企业都能够获得认证。ISO Global 一直与认证机构密切合作，提供特殊费率和方案，使小企业更能负担得起认证费用。
小型企业面临的另一个问题是项目负责人有其他职责，没有时间领导系统开发。另一个问题是项目负责人在企业内部没有影响力。
